国内食品、药品企业传统的消毒方法是使用紫外线灯照射但紫外线的消毒效果受很多因素的影响，如照射强度、距离等，并且很容易存在消毒死角。而臭氧具有消毒灭菌速度快（3000倍于紫外线，600倍于氯）、消毒无死角、无任何残留物、使用方便等优点。所以近年来国家商检、质量、卫生等监管部门已明确要求相关企业淘汰紫外线灯，推荐使用臭氧发生器对空间和生产用水进行杀菌消毒。
在实际应用中，影响食品臭氧发生器消毒效果的因素主要有以下几方面。
1.臭氧的均匀度
在消毒空间内，必须保证所有角落的臭氧浓度都能够达到消毒标准，否则消毒效果还是很差。为此，在设计消毒方案时，必须周密考虑车间结构、臭氧投加方式、臭氧发生器性能等因素。臭氧发生器必须具有远距离输送臭氧的能力，空间消毒的话最好选用空气源的臭氧发生器，如果车间有新风系统，当然最好，可以将臭氧发生器接到出风口；如果没有新风系统可以选择铺设管道的方式，但是臭氧的投加量比标准投加要稍微大一些。
2.臭氧投加量
空间消毒是如果臭氧的投加量达不到标准数值，那么空间内的臭氧浓度也达不到要求的标准，消毒效果必然受影响。在计算臭氧投加量时，必须考虑臭氧在输送过程中的损耗、门窗泄露等综合因素，同时，也必须保证所选用的臭氧发生器能够达到设计的臭氧产量。
3.臭氧发生器的性能
如果臭氧发生器的性能较差，在使用到一定时间后，臭氧产量会急剧减少，那么消毒效果将无从保证。臭氧发生器的核心部件就是臭氧放电体和专用电源，所以在采购时，要选择可靠的臭氧发生器厂家，要考虑臭氧放电体和电源的匹配性，最好是厂家自己研发生产。
4.臭氧消毒的时间
虽然臭氧的消毒灭菌作用是在瞬间完成的，但臭氧浓度在空间内需要一定时间的积累，如果消毒时间不够，消毒效果也会受影响。一般要求臭氧发生器停机半小时到一小时内，仍需密闭门窗。
5.其他
空间内环境温度、湿度、密封程度、空气洁净度等，都会影响臭氧的消毒效果。使用臭氧发生器的环境温度不要超过40摄氏度，湿度最好在60%-80%之间，空气经过过滤净化的空间。
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