接种室，培养室将臭氧发生器安装在食用菌培养室室外，通过硅胶管接连到培养室内房顶20-25CM的地方（臭氧比空气重1.6倍左右），对洁净区进行消毒灭菌。
采用臭氧发生器连接导气管，在食用菌培养室，接菌室，黑木耳深加工厂顶部布设管道，将臭氧送入洁净区。特别是在食用菌生产前把各菌房用臭氧提前杀菌消毒。几种方法消毒效果都是一样的。从使用臭氧进行灭菌的食用菌厂的检测报告可看到，菌检全部合格，完全替代了令人头痛的甲醛，硫磺熏蒸大消毒同时，能耗减少，人身健康，取得了满意效果。
物体的表面消毒灭菌在食用菌生产过程中，常常要对原材料，工具器材，包装物，生产场所等进行体表面消毒。特别是要对调好的培养基在臭氧消毒下进行多次翻动摊开消毒。在高压灭菌时效果更好，高压灭菌后的菌代口极易感染杂菌这时做表面杀菌非常重要。传统的方法是用紫外线消毒，但消毒不彻底，存在消毒死角，衰减快，对于特定环境中的某些细菌无法杀死等种种弊端。按照卫生部消毒技术规范要求，用臭氧气体对物体表面上污染的微生物的杀灭。
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